San Pablo Burgos geht auf den 1994 gegründeten Club Baloncesto Miraflores zurück, der zunächst im regionalen Basketball aktiv war. Im August 2015 entstand die Profimannschaft, die unter dem Namen San Pablo Burgos in der zweiten spanischen Liga antrat. Nach dem ersten Aufstieg in die ACB im Jahr 2017 zog die Mannschaft in das Coliseum Burgos um. Ihre größten internationalen Erfolge feierte sie mit dem Gewinn der Basketball Champions League 2020 und 2021 sowie des FIBA Intercontinental Cup 2021. Nach dem Abstieg 2022 gelang dem Verein 2025 die Rückkehr in die höchste spanische Spielklasse.